En la fase de grupos del torneo los ‘Escarlatas’ clasificaron invictos, sumando 14 puntos, de 18 posibles.
América de Cali, que ha tenido varias glorias a lo largo de su historia, se coronó campeón de la Copa Merconorte en 1999. Dicho título fue muy especial porque fue el primer torneo internacional que ganó en su historia.
Jaime de La Pava, entrenador y exjugador del equipo rojo, fue el encargado de poner a celebrar a los hinchas ‘Escarlatas’ en aquel entonces, dejando un trofeo que se recuerda con mucho cariño y emoción.
En la fase de grupos, ‘La Mecha’ se enfrentó a El Nacional (Ecuador), Atlético Nacional y Universitario. Clasificando invicto a la siguiente ronda. Acumuló 14 puntos, dejando un balance de 6 partidos jugados, 4 ganados y dos empatados.
En la semifinal se enfrentó a Alianza Lima. A los peruanos los venció 1-3 en condición de visitante, pero posteriormente perdió 0-2 en el estadio Pascual Guerrero. Se terminó quedando col el cupo a la final tras ganar 3-4 en los penales, tras el empate global.
En la final, el rival fue Independiente Santa Fe. El primer partido se jugó en el estadio Pascual Guerrero. ‘La Mechita’ perdió 2-1, lo que dejó todo abierto para el partido de vuelta en Bogotá. En dicho encuentro, el 22 de diciembre de 1999, América se impuso 0-1 con un gol de Jairo ‘El Tigre’ Castillo, empatando el juego y llevándolo a la definición de tiros desde el punto penal. América se terminó quedando con el trofeo tras ganar la tanda 5-3.
América: Diego Gómez: Wilson Pérez, Pablo Navarro, Carlos González, Jersson González; Fabian Vargas, Mauricio Romero, Ángel Perafán, William Zapata, Franki Oviedo, Diego Bonilla; Jairo Castillo, Julián Téllez y Leonardo Fabio Moreno. DT Jaime de la Pava.
Independiente Santa Fe: Agustín Julio; Iván López, Adelmo Vallecilla, Hilario Cuenú, Edison González; Luis García, Iván Velásquez, Emir González, Luis Moreno, Aldo Ramírez, David Hernández; Wilson Cano y Jeffrey Díaz. DT: Fernando Castro.
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